في 2 يوليو/تموز 1962، أبرمت الدولة الإسبانية، التي مثلها وكيل الشؤون الخارجية يومئذ السيد بيدرو كورتينا ماوري، والمجلس الدولي لزيت الزيتون، الذي مثله مديره التنفيذي السيد لوسيان ديني، الاتفاق الأول للمقر. وتنص ديباجة هذا الاتفاق على أن قرار اختيار مقر المجلس الدائم في مدريد قد أتخذ في الدورة الأولى للمنظمة سنة 1959. في يوم 13 يوليو/تموز 1989، وقع اتفاق ثان للمقر بين مملكة إسبانيا والمجلس لإيجاد إطار قانوني جديد يأخذ في الاعتبار التغيرات الزمنية الطارئة. وفي هذه المناسبة، وقع الاتفاق وزير إسبانيا في الشؤون الخارجية، السيد فرانثيسكو فرنانديث أوردونييث، والمدير التنفيذي الحالي للمجلس، السيد فاوستو لوقيتي، ثم صدق عليه صاحب الجلالة الملك خوان كارلوس الأول لإسبانيا.

يستجيب هذا الاتفاق لمحتوى المادة 6 من اتفاقية 1986 الدولية لزيت الزيتون وزيتون المائدة التي استلزمت تحديث اتفاق المقر الأول، ومحتوى المادة 3 التي تعين رسميا مقر المجلس في مدريد. ما تزال العلاقات بين المجلس ومملكة اسبانيا قائمة اليوم على اتفاق المقر المبرم سنة 1989، وفقا لنص برتوكول 1993 الذي يعدل ويجدد اتفاقية 1986 الدولية لزيت الزيتون وزيتون المائدة السارية المفعول حاليا.